Com as mudanças, as certificadoras se depararam com alguns problemas que poderiam impedir a acreditação junto aos órgãos definidos, tais como a falta de alinhamento técnico entre INMETRO e a ANP e a necessidade de contratação de profissionais capacitados para exercerem as atividades doravante requeridas.

Essa adequação exigiu investimentos consideráveis, o que levou a um alto custo para a acreditação. Até então, as certificadoras, em sua maioria, não eram empresas ligadas ao INMETRO, logo não tinham as práticas e a metodologia do referido órgão. Assim, precisaram adotar uma alta expertise técnica e se viram obrigadas a investir em uma equipe especializada.

Com o alto investimento atrelado a uma baixa demanda pelos serviços, esse desequilíbrio cobrou um preço alto, ocasionando a extinção de muitas Certificadoras.